知网是广泛使用的文献查重工具，初稿格式错误可能导致查重结果不准确。处理方法包括：1.仔细检查格式要求，如字数、字体、行距等；2.使用专业编辑工具进行格式调整；3.逐段检查文本，确保格式统一；4.查看知网查重报告，找出格式错误的部分并及时修改。

另外，还可以请教导师或同行进行审阅，以发现并纠正初稿格式错误。此外，注意备份文档，避免因格式错误导致文档丢失。最后，再次进行查重确认，确保修改后的文档符合格式要求，提高查重准确性。